NGF诱导PC12细胞早期分化的DIGE分析 篇一
NGF(神经生长因子)作为神经细胞分化和发育过程中的重要调节因子,对于神经系统的正常功能发挥起着至关重要的作用。PC12细胞是一种来源于大鼠肾上腺髓质的神经嗜铬细胞瘤细胞株,被广泛应用于研究神经分化和神经发育的相关机制。本文旨在通过DIGE(双向凝胶电泳)技术,对NGF诱导PC12细胞早期分化的蛋白质组进行分析,以探究NGF调控细胞分化的分子机制。
首先,我们将PC12细胞分为两组:对照组和NGF处理组。对照组接种在含有培养基的培养皿中,而NGF处理组则在培养基中添加一定浓度的NGF。经过一定时间的培养后,我们将细胞收集并进行蛋白质提取。接下来,我们使用DIGE技术对两组样品进行荧光标记,其中对照组样品使用绿色荧光染料标记,NGF处理组样品使用红色荧光染料标记。标记后的样品混合并加载到双向凝胶电泳中进行分离。
在双向凝胶电泳过程中,我们首先将样品按照等量加载到等电聚焦胶上进行等电聚焦。随后,我们将等电聚焦胶转移到SDS-PAGE胶上进行二维蛋白质分离。分离完成后,我们使用荧光成像系统对胶进行扫描,记录下绿色和红色荧光信号的强度。通过比较绿色和红色荧光信号的差异,我们可以筛选出在NGF诱导下显著表达差异的蛋白质斑点。
接着,我们将筛选出的差异蛋白质斑点进行切割、洗脱和鉴定。通过质谱分析技术,我们可以鉴定出每个差异斑点中的蛋白质成分,并进一步分析其功能和参与的生物过程。此外,我们还可以通过生物信息学分析,预测差异蛋白质斑点的亚细胞定位、相互作用网络和信号通路。
通过以上步骤,我们可以获得NGF诱导PC12细胞早期分化的蛋白质组变化情况。这些差异蛋白质可能参与了细胞分化、神经元生长和突触形成等生物过程。进一步的研究可以通过蛋白质相互作用实验和功能实验来验证这些差异蛋白质的作用机制。
综上所述,通过DIGE分析NGF诱导PC12细胞早期分化的蛋白质组,我们可以深入了解NGF调控细胞分化的分子机制。这将为神经发育和神经退行性疾病的研究提供重要的理论依据和潜在的治疗靶点。
NGF诱导PC12细胞早期分化的DIGE分析 篇二
NGF(神经生长因子)是一种在神经系统中起着重要作用的蛋白质,它能够促进神经细胞的生长和分化。PC12细胞是一种常用的神经细胞模型,其可以通过NGF诱导分化为神经样细胞。本文利用双向凝胶电泳(DIGE)技术,对NGF诱导PC12细胞早期分化的蛋白质组进行分析,以寻找与细胞分化相关的差异蛋白质。
首先,我们将PC12细胞分为对照组和NGF处理组。对照组接种在含有培养基的培养皿中,而NGF处理组则在培养基中添加一定浓度的NGF。接下来,我们将细胞收集并进行蛋白质提取。蛋白质提取后,我们使用荧光染料对两组样品进行标记。对照组样品使用绿色荧光染料标记,NGF处理组样品使用红色荧光染料标记。标记后的样品混合并加载到双向凝胶电泳中进行分离。
双向凝胶电泳是一种常用的蛋白质分离技术,可以同时分析两组样品之间的差异。在电泳过程中,我们首先将样品加载到等电聚焦胶上进行等电聚焦。等电聚焦过程中,蛋白质根据其等电点的差异在胶上进行分离。随后,我们将等电聚焦胶转移到SDS-PAGE胶上进行二维蛋白质分离。分离完成后,我们使用荧光成像系统对胶进行扫描,记录下绿色和红色荧光信号的强度。通过比较两组样品之间的荧光信号差异,我们可以筛选出差异蛋白质斑点。
接下来,我们对筛选出的差异蛋白质斑点进行切割、洗脱和鉴定。通过质谱分析技术,我们可以鉴定出每个差异斑点中的蛋白质成分,并进一步分析其功能和参与的生物过程。此外,我们还可以通过生物信息学分析,预测差异蛋白质斑点的亚细胞定位、相互作用网络和信号通路。
通过以上步骤,我们可以获得NGF诱导PC12细胞早期分化的蛋白质组差异。这些差异蛋白质可能参与了细胞分化、神经元生长和突触形成等生物过程。进一步的研究可以通过功能实验来验证这些差异蛋白质的作用机制。
总之,通过DIGE分析NGF诱导PC12细胞早期分化的蛋白质组,我们可以深入了解NGF调控细胞分化的分子机制。这对于揭示神经发育和神经退行性疾病的发生机制具有重要意义。
NGF诱导PC12细胞早期分化的DIGE分析 篇三
NGF诱导PC12细胞早期分化的DIGE分析
目的筛选神经生长因子(Nerve growth factor,NGF)处理后PC12细胞分化早期相关蛋白,寻找NGF药物作用靶点,为深入进行神经保护药物的研发提供理论依据.方法在建立NGF诱导PC12细胞分化模型的基础上,分别提取NGF处理前后的细胞总蛋白,应用荧光差异凝胶电泳(Differential Gel Electrophoresis,DIGE)系统获得蛋白点表达差异信息,运用MALDI-TOF质谱鉴定出差异蛋白质.结果NGF处理组有7个蛋白点发生变化;通过数据库检索,鉴定了3种结构和功能各异的`蛋白.结论eEF-2、Rab GDIα和DPPⅢ与NGF诱导PC12细胞分化早期过程有关,可能是NGF的作用靶点.
作 者:侯澍 胡林森 常明 吴江 张磊 李红杰 作者单位:吉林大学第一医院神经内科,吉林,长春,130021 刊 名:中风与神经疾病杂志 ISTIC PKU 英文刊名: JOURNAL OF APOPLEXY AND NERVOUS DISEASES 年,卷(期): 200623(1) 分类号: Q503 关键词: PC12细胞 NGF 蛋白质组学 DIGE